Predstavniki verskih skupnosti v Sloveniji so ob smrti papeža Frančiška poslali predsedniku Slovenske škofovske konference msgr. dr. Andreju Sajetu sožalna pisma.
Škof Evangeličanske cerkve v Sloveniji mag. Leon Novak je svojem pismu izrazil iskreno sožalje ob smrti papeža Frančiška, ki je umrl na velikonočni ponedeljek – dan, ko se verniki spominjajo poti učencev v Emaus. V pismu škof Leon Novak izpostavlja papeževo odprtost do ljudi, njegovo zavzetost za ekumenizem in posebno hvaležnost za njegov obisk pri skupnem bogoslužju ob 500-letnici reformacije v Lundu. Poudaril je njegov čut za sočloveka, tudi s konkretnimi dejanji, kot je skrb za brezdomce v Rimu. Papež Frančišek je po besedah škofa Novaka zaznamoval Cerkev kot pobožen in spoštljiv voditelj, ki je deloval v slavo Boga in za dobro ljudi. Svoje pismo je sklenil s sporočilom velikonočnega upanja: "Kristus je vstal in z njim bomo vstali tudi mi."
Predstavniki Islamske skupnosti v Republiki Sloveniji izražajo iskreno sožalje ob smrti papeža Frančiška. Mufti mag. Nevzet Porić je v pismu poudaril izjemno osebnost papeža Frančiška, ki je bila cenjena ne le med katoličani, ampak tudi med muslimani, predvsem zaradi njegove odprtosti, prizadevanj za dialog, pravičnost in mir. Spomnijo se tudi pomembnega srečanja papeža Frančiška z velikim imamom Ahmedom Et Tajjibom, ki je prispevalo h krepitvi odnosov med kristjani in muslimani. Mufti je izrazil spoštovanje do Frančiškovega dela ter upanje, da bodo takšni odnosi in prizadevanja za skupno dobro nadaljevani tudi v prihodnje.